Protéomique - La copurification par affinités progresse

La méthode de purification des protéines TAP (Tandem Affinity Purification) permet d’isoler des complexes protéiques sans les perturber, pour ensuite les analyser par spectrométrie de masse, mais elle n’est que faiblement efficace si elle est appliquée à des cellules de mammifères.

En réponse, Tilmann Bürckstümmer, Giulio Superti-Furga et leurs collègues du Centre de recherche en médecine moléculaire de l’Académie autrichienne des sciences (CeMM - Research Center for Molecular Medicine) ont développé un système de tags alternatifs. Les étiquettes constituées de fragments d’immunoglobulines G et d’un peptide liant la streptavidine se sont révélées être 10 fois plus efficaces que les étiquettes préexistantes : elles permettent d’isoler jusqu’à 10 fois plus de complexes protéiques.

Les tags développés devraient faciliter l’analyse de la machinerie cellulaire des mammifères, comme le tag TAP avait facilité celle de la machinerie cellulaire des levures. Une étude sur Ku70-Ku80 l’a montré en isolant de nouveaux effecteurs potentiels de la protéine, pourtant déjà largement étudiée.

Pour en savoir plus :

• CeMM/Research Center for Molecular Medicine of the Austrian Academy of Sciences, Lazarettgasse 14, AKH BT 25.3, AT-1090 Wien, tél. : +43 1 40160 70 011, fax : +43 1 40160 970 000, office@cemm.oeaw.ac.at, https://cemm.at/
• Tilmann Bürckstümmer, Keiryn L. Bennett, Adrijana Preradovic, Gregor Schütze, Oliver Hantschel, Giulio Superti-Furga, Angela Bauch (2006). ‘An efficient tandem affinity purification procedure for interaction proteomics in mammalian cells’, Nature Methods, 3:1013–1019, doi:10.1038/nmeth968